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Génomique

Génétique | Génomique | Ruminants (général)

Importance de la méthode d’analyse statistique des données du transcriptome.

J.F. HOCQUETTE, I. BARNOLA, C. BERNARD, B. MEUNIER, K. SUDRE, A. LISTRAT, I. CASSAR-MALEK

INRA, Unité de Recherches sur les Herbivores, Equipe Croissance et Métabolisme du Muscle, Theix, 63122 Saint-Genès Champanelle, France

INTRODUCTION

L’analyse du transcriptome est basée sur l’hybridation moléculaire des ARN d’un tissu cible (après rétrotranscription en ADNc et marquage) avec des ADNc déposés sur un support (membranes de nylon, lames de verre). De plus, le même échantillon biologique peut être analysé avec plusieurs membranes ou lames différentes pour estimer la variabilité technique de la mesure. Ce travail, réalisé dans le cadre du programme AGENAE (Analyse du GENome des Animaux d’Elevage), a pour objectif de comparer différentes méthodes de dépouillement ou d’analyse statistique des données du transcriptome.

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